Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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