Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAMK2DQ13557 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms