Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCIRG1Q13488 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
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