Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PMS2P3Q13401 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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