Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms