Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATMQ13315 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms