Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RESTQ13127 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RESTQ13127 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RESTQ13127 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RESTQ13127 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RESTQ13127 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RESTQ13127 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RESTQ13127 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RESTQ13127 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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