Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF5Q12774 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF5Q12774 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms