Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDE4DQ08499 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms