Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSME1Q06323 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms