Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN12Q05209 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms