Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NHLH2Q02577 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms