Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms