Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms