Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms