Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P62684 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P62684 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms