Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CABP4P57796 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CABP4P57796 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CABP4P57796 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CABP4P57796 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABP4P57796 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABP4P57796 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms