Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DAP3P51398 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DAP3P51398 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms