Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC1P48995 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms