Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NESP48681 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NESP48681 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NESP48681 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NESP48681 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NESP48681 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NESP48681 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NESP48681 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NESP48681 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NESP48681 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NESP48681 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NESP48681 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NESP48681 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NESP48681 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms