Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRXP46100 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRXP46100 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRXP46100 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRXP46100 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRXP46100 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms