Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms