Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPS1P31327 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CPS1P31327 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPS1P31327 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPS1P31327 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms