Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms