Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DMAP28067 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms