Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APCP25054 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APCP25054 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APCP25054 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APCP25054 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APCP25054 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APCP25054 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APCP25054 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms