Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCHP24723 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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