Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGA3P0DJD8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms