Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOP08100 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOP08100 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms