Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THY1P04216 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THY1P04216 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THY1P04216 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THY1P04216 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms