Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

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Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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