Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCAO15360 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCAO15360 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCAO15360 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCAO15360 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCAO15360 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms