Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA3AA6NCI4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms