Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB5A4FU69 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB5A4FU69 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB5A4FU69 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB5A4FU69 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EFCAB5A4FU69 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms