Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NBASA2RRP1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms