Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC27A6Q9Y2P4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms