Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MBD5Q9P267 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MBD5Q9P267 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms