Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNK4Q9NYG8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms