Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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