Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A1Q9NY26 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.7 ms