Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCLQ9NW38 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms