Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms