Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHACTR1Q9C0D0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms