Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms