Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRBNQ96SW2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms