Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A9Q96Q91 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms