Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC136Q96JN2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms