Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BORCS6Q96GS4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BORCS6Q96GS4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms