Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC59Q96AG4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms