Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms